Amber 是一款分子动力学（MD）软件包，最初由彼得·科勒曼（Peter Kollman）及其研究团队与合作者提出，用于模拟生物分子体系。其 pmemd 模块提供适用于中央处理器（CPU）的串行版本，以及针对 NVIDIA 和 AMD 图形处理器（GPU）的版本，同时还支持基于消息传递接口（MPI）的并行计算版本。该软件具备多种高级功能，包括热力学积分、复制交换分子动力学（replica exchange MD）以及加速分子动力学（accelerated MD）等方法。本文档简要介绍了该软件的最新更新及其近期新增的功能特性。